• развитие фундаментальных теоретических исследований по вопросам биотехнологии и генетики, иммунитета, микробиологии, физиологии и биохимии растений;
• разработка и совершенствование эффективных методов селекционного процесса зернобобовых и крупяных культур;
• создание новых сортов гороха, фасоли, вики посевной, кормовых бобов, чечевицы, сои, клевера лугового, гречихи и проса, сочетающих высокую продуктивность с устойчивостью к стресс-факторам и вредным организмам на основе комплексной оценки генофонда и селекционного материала по основным показателям хозяйственно-ценных признаков и свойств;
• разработка и совершенствование экономически обоснованных технологий производства зернобобовых и крупяных культур, позволяющих максимально реализовать генетический потенциал растений в конкретных экологических зонах при минимальных энергетических затратах;
• организация первичного семеноводства селектируемых культур;
• координация научно-исследовательских работ и методическое руководство сетью научных учреждений, занимающихся изучением зернобобовых культур, гречихи, проса в стране.

В ФНЦ ЗБК сосредоточен уникальный генофонд растительных ресурсов, включающий доноры и генетические источники важнейших хозяйственно-ценных признаков и свойств зернобобовых и крупяных культур, который ежегодно пополняется новыми формами и сортообразцами.
Благодаря этому ФНЦ ЗБК создано более 200 сортов гороха, вики, фасоли, кормовых бобов, чечевицы, гречихи, проса, клевера, из которых свыше 120 сортов были допущены к использованию в сельскохозяйственном производстве, в том числе 30 сортов гороха, 12 вики посевной, 25 гречихи и 15 сортов проса. Сорта ФНЦ ЗБК обладают высоким уровнем адаптации к различным почвенно-климатическим зонам, о чём свидетельствует широкий спектр регионов их возделывания.
Учёные ФНЦ ЗБК успешно решают задачу интенсификации всего комплекса научных исследований, включающего и создание сортов, и обеспечение их надёжной технологией возделывания и производство семян высших репродукций. Ими созданы новые высокопродуктивные сорта с комплексом хозяйственно ценных признаков, выявлены физиологические механизмы высокой продуктивности и качества продукции, разработаны высокоэффективные системы удобрения зернобобовых и крупяных культур, биологические и химические методы защиты растений от болезней, вредителей и сорняков, системы севооборотов и ландшафтного земледелия, научные основы системы семеноводства.
Учёными ФНЦ ЗБК разработаны новые методы и схемы селекции, важнейшие элементы земледелия и технологии возделывания зернобобовых культур, гречихи и проса; обоснованы системы севооборотов и обработки почвы; изучены особенности питания растений; выполнен большой объём теоретических исследований по генетике, биотехнологии, иммунитету, физиологии и биохимии растений.

Учёные ФНЦ ЗБК успешно решают задачу интенсификации всего комплекса научных исследований, включающего и создание сортов, и обеспечение их надёжной технологией возделывания и производство семян высших репродукций. Ими созданы новые высокопродуктивные сорта с комплексом хозяйственно ценных признаков, выявлены физиологические механизмы высокой продуктивности и качества продукции, разработаны высокоэффективные системы удобрения зернобобовых и крупяных культур, биологические и химические методы защиты растений от болезней, вредителей и сорняков, системы севооборотов и ландшафтного земледелия, научные основы системы семеноводства.
Свой вклад в разработку всех этих вопросов вносят доктор с.х. наук, профессор В.И. Зотиков, член-корреспондент РАН; доктор биол. наук А.Н. Фесенко, кандидаты с.х. наук В.С. Сидоренко, И.В. Кондыков, З.Р.Цуканова, Г.А. Борзёнкова, Г.Н. Суворова и другие.